基于Sanger和NGS测序的19例散发型梭形细胞血管瘤突变分析△▲
TenBroekRW,BekersEM,etal.
摘要
梭形细胞血管瘤(SCH)是一种发生于浅表软组织的血管肿瘤,由海绵状血管瘤样区域和实性梭形细胞区域组成,好发于年轻人,多见于肢体末端。大部分病例中伴有IDH1/2杂合子突变,偶见于Maffucci综合征。然而,由于嵌合现象及低比例的具有突变体等位基因的病变细胞,导致检测具有一定难度。本文应用Sanger测序、多重连接探针扩增技术(MLPA)、常规高通量测序(NGS),以及基于单分子反转探针(smMIP)文库构等测序方法检测19例散发型梭形细胞血管瘤,并比较其诊断价值。10例应用Sanger测序,2例应用MLPA技术,其中Sanger测序检测到4例IDH1突变(p.RC),MLPA技术检测到1例IDH1突变(p.RC)。应用smMIP/NGS进行检测剩余7例阴性病例和补充6例病例,显示IDH1(p.RC)热点突变8例,IDH2(两次p.RS和一次p.RG)热点突变3例。有1例是阴性的。由于DNA质量不佳及覆盖深度不足,去除2例。总共,17例中有16例成功检测到IDH1/2突变。考虑到应用smMIP/NGS检测在例其他血管病变中未检测到IDH1/2突变,该突变在梭形细胞血管瘤中具有高度特异性。
引言
梭形细胞血管瘤是一种罕见的血管性病变,主要由卡波西肉瘤样梭形细胞样和海绵状血管瘤样区域组成,Weiss和Enzinger首次描述,并命名为梭形细胞血管内皮瘤,基于其潜在的转移倾向,归类为低级别血管肉瘤[1,2]。此后,它在一组病例中考虑为良性病变,并伴有多灶性发生,而不是转移性疾病[3,5],可能代表躯体障碍疾病[6,7]。
自年发现后,年首次报道Maffucci综合症具有特殊的血管病变。然而,梭形细胞血管瘤在Maffucci综合征中的发生率较低,高达9%的患者梭形细胞血管瘤旁边可见骨内软骨肿瘤;都是年轻患者[3]。
IDH1/2突变是Maffucci综合征中软骨和血管病变的遗传特征[6,7],高度特异性的散发型梭形细胞血管瘤[8]、骨内散发型中央软骨肉瘤及内生软骨瘤中也有过报道[6]。相反,其他血管病变/异常中未见IDH1/2突变[8]。因此,IDH1/2突变可有助于鉴别诊断梭形细胞血管瘤与海绵状血管肿瘤[8]。
本文应用Sanger测序,多重连接探针扩增(MLPA),常规下一代测序(NGS)和基于单分子反转探针(smMIP)构建文库法测序研究了19例梭形细胞血管瘤,并比较这些检测方法的诊断价值。此外,我们检测了例其他血管病变/异常来评估IDH1/2热点突变的特异性,并明确其在血管病变中鉴别诊断的价值。
材料与方法
??材料:
所有样本使用4%福尔马林缓冲液固定,常规处理后石蜡包埋,切片厚度4um。
??方法:
?NGS检测:
使用靶向肿瘤hotspotpanel(CancerHotspotPanelv2,ThermoFisher)和theIonTorrentPGM(ThermoFisher)进行测序[9]。
?smMIPs:
使用NextSeq(Illumina)构建文库进行检测。
?PCR和Sanger测序:
Chelex法(Sanger)、CobasDNAsampleprepkit(Roche,用于NGS分析)或直接裂解法(MLPA分析)从经福尔马林固定及石蜡包埋的组织(FFPE)中获取DNA,并使用Qubit法测定DNA浓度。获取的DNA用于PCR检测和Sanger测序。
?MLPA分析:使用P-C1kit(MRCHolland)分析。
?例血管病变分类基于年ISSVA分类[11],见表1。
表1.IDH1/2野生型血管异常
结果
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临床资料
??19例患者的临床资料均基于病理报告和临床记录(见表2)。简而言之,10例女性患者,9例男性患者,年龄5-69岁(中位年龄36岁;平均年龄38岁)。14例患者肿瘤主要位于远端(5例位于足,2例位于脚趾,2例位于小腿,1例位于手指,3例位于前臂,1例位于前臂/手)。2例病变位于上臂,1例病变位于大腿,1例位于肩胛骨,1例位于腹壁。4例患者同一部位具有多灶性肿瘤(双脚和前臂可分别见两处病变)。
??根据组织学,病变位于真皮、皮下和骨骼肌,直径0.3~3.5cm(平均1.4cm)。所有肿瘤均完全切除。其中3例复发。根据临床资料,没有证据表明所有患者有Maffucci综合症或其他综合症的病史。
表02
临床资料
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组织学特点
??大部分病灶为边界清楚的结节,海绵状血管瘤样区域内的血管多为扩张的薄壁血管,大小不一,充满血液(图1),部分梭形细胞成分较分散,疏密相间,细胞核大小一致(图2和图3)。部分区域内还含有数量不等的上皮样空泡状细胞,机化性的血栓有时伴有继发性钙化。此外,部分病变还伴有成片的嗜酸性粒细胞,平滑肌细胞。
??免疫组化显示,所有病例的内皮细胞均有CD31和CD34表达阳性,梭形细胞中CD34表达阴性。血管外周细胞,平滑肌细胞和梭形细胞中有SMA表达。3例病例HHV-8LANA染色阴性,排除卡波西肉瘤。
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